嘉庚学院实行学分制管理。按照福建省发展和改革委员会2022年核定的收费标准收费（闽发改价格函〔2022〕355号），2026年秋季入学新生学费标准如下： 
1.财政学、税收学、金融学、国际经济与贸易、法学、汉语言文学、英语、日语、新闻学、广播电视学、广告学、大数据管理与应用、信息管理与信息系统、工商管理、市场营销、会计学、财务管理、国际商务、文化产业管理、行政管理、物流管理、电子商务各专业，每人每学年学费 21000元。
2.机械设计制造及其自动化、机械电子工程、车辆工程、电气工程及其自动化、电子信息工程、通信工程、光电信息科学与工程、自动化、机器人工程、计算机科学与技术、软件工程、物联网工程、智能科学与技术、数据科学与大数据技术、土木工程、工程造价、给排水科学与工程、环境科学与工程、资源环境科学、建筑学、城乡规划、智能制造工程各专业，每人每学年学费 23000元。

3.音乐表演、音乐学、舞蹈表演、视觉传达设计、环境设计、产品设计、动画各专业，每人每学年学费 25000元。

住宿费标准分两档：安排入住标准公寓的，每人每学年1380元（含空调安装费）；安排入住其他类型宿舍的（非独立卫生间，共用卫生间人数超过4人），每人每学年1150元（含空调安装费）。